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 過完春節，李登輝判刑即將確定，彭明敏及部分台獨大老會見民進黨黨主席，決定在高雄發起支持李登輝遊行。三月選統選舉完兩週年的某個週末，有二十五萬民眾走上街頭要求釋放李登輝、陳水扁，高雄市長謝長廷上台演講，蕭萬長宣布加入民進黨，並宣稱連戰即將被宋楚瑜清算。到了解散時間，政府並未有適當回應後，民眾遲遲不肯散去，示威活動持續進行。
五天後，仍有十萬民眾在高雄勞工公園聚集。中央政府要求高雄市政府勒令解散，高雄市長謝長廷拒絕。
四月初，高雄示威仍未有效解決，根據國外媒體統計每天均保持有十五萬人聚集，宋楚瑜宣布關於舊政府貪污情形其實李登輝應是受到連戰等人的欺瞞，下令逮捕連戰及蕭萬長等人，李登輝在法院的判決之下暫時獲得釋放，石原慎太郎來台會見李登輝。
四月二十五日，示威活動在李登輝獲釋後結束。
五月，內閣再度改組，為了安撫民進黨，宋楚瑜詢問蘇貞昌等人入閣意願遭拒，但仍宣布范振宗出任政務委員，國防部長則由郝龍斌接任。同時，馬英九宣布競選連任，朱安雄獲得國民黨提名參選高雄市長。
七月，宋楚瑜被自由時報爆料派密使赴中國，總統府斷然否認，國民黨發言人陳文茜宣稱自由時報林榮三是挾怨報仇。ccts2100全民開講宣布製作林榮三與宋楚瑜的恩怨情仇，總共十五集。聯合報響應愛國同心會發起的退自由時報救中華民國運動。全國公營行庫宣布將不再訂閱自由時報。
十月，宋楚瑜出國訪問，過境美國，美國在台協會主席向宋楚瑜抗議李登輝事件後離席，美國低規格接待。
十一月，台北市長馬英九發表欣見2008年北京奧運棒球項目在台北舉行。
十二月，北高兩市長改選，馬英九以六成票數擊敗民進黨提名的蘇貞昌，朱安雄則以兩千票險勝因中央不肯配合建設而政見跳票連連的現任市長謝長廷。
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